Un giorno di ottobre, improvvisamente, il 2% della popolazione mondiale (140 milioni di persone) scompare in un solo istante. Alcuni si convincono che la Terra sia stata colpita dal "Rapimento della Chiesa", altri rifiutano di vederlo come un evento mistico, e nessuno, in realtà, sa veramente cosa sia accaduto. La serie ha inizio tre anni dopo l'evento, e segue le vicende della comunità di Mapleton, dove sono scomparsi nel nulla oltre cento abitanti.
Una piccola città del Texas è stata rinominata Miracle perché nessun abitante è svanito. La città diventa meta di pellegrinaggio. Le famiglia del reverendo Jamison e di Kevin si trasferiscono a Miracle.
Nora accetta l’offerta di un’acquirente con una curiosità morbosa e vende la casa. Quando arrivano a Miracle usa i soldi per acquistare una casa senza prima vederla.
Laurie e Tom lavorano insieme per salvare coloro finiti nella setta dei Colpevoli Sopravvissuti. Laurie decide di scrivere un libro sulla sua esperienza. Tom si infiltra nella setta e porta alla luce nuovi problemi.
Un terremoto colpisce Miracle, Nora si veglia e non trova Kevin al suo fianco. Quando Kevin ritorna, non ricorda dove sia stato e non trova il suo telefono. La scomparsa della figlia Evie getta i Murphy nel panico.
Matt porta la moglie fuori da Miracle per scoprire qualcosa di più sulle sue condizioni, ma deve lottare contro coloro che sperano di ottenere il pass per la cittadina e si accalcano appena fuori le porte di Miracle.
Nora riceve una visita inaspettata e viene accusata della scomparsa di Evie. Nel frattempo alcuni scienziati hanno sviluppato una nuova teoria sulle sparizioni. Kevin continua ad avere visioni su Patti.
Jill e Kevin ricevono alcune notizie scioccanti da Nora. Laurie prende una decisione improvvisa che ha delle conseguenze su tutta la famiglia. Kevin va da una Virgil, una sorta di sciamano, per risolvere il problema delle sue visioni.
La perdita di una persona cara aveva condotto Meg verso i Colpevoli Sopravvissuti. Adesso Meg si reca in pellegrinaggio a Miracle. Dopo un litigio con Laurie, Tom cerca di riunirsi a Meg.
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