Un giorno di ottobre, improvvisamente, il 2% della popolazione mondiale (140 milioni di persone) scompare in un solo istante. Alcuni si convincono che la Terra sia stata colpita dal "Rapimento della Chiesa", altri rifiutano di vederlo come un evento mistico, e nessuno, in realtà, sa veramente cosa sia accaduto. La serie ha inizio tre anni dopo l'evento, e segue le vicende della comunità di Mapleton, dove sono scomparsi nel nulla oltre cento abitanti.
Laurie e Tom lavorano insieme per salvare coloro finiti nella setta dei Colpevoli Sopravvissuti. Laurie decide di scrivere un libro sulla sua esperienza. Tom si infiltra nella setta e porta alla luce nuovi problemi.