Un giorno di ottobre, improvvisamente, il 2% della popolazione mondiale (140 milioni di persone) scompare in un solo istante. Alcuni si convincono che la Terra sia stata colpita dal "Rapimento della Chiesa", altri rifiutano di vederlo come un evento mistico, e nessuno, in realtà, sa veramente cosa sia accaduto. La serie ha inizio tre anni dopo l'evento, e segue le vicende della comunità di Mapleton, dove sono scomparsi nel nulla oltre cento abitanti.
Sono trascorsi tre anni da quando Miracle è stata invasa dai CS e Kevin lavora di nuovo come poliziotto. In giro la gente pensa che con il settimo anniversario della Dipartita porterà una catastrofe apocalittica.
In una gara contro il tempo in vista dell'anniversario della Dipartita, Kevin Garvey Sr. sta seguendo una visione che potrebbe un messaggio divino per salvare il mondo dall'apocalisse.
Kevin e Nora si recano in Australia dove lei continua a seguire i responsabili di un elaborata truffa. Kevin intravede un volto nella folla e questo lo costringe ad affrontare i traumatici eventi di tre anni prima.
Convinto del destino di Kevin per quanto riguarda l'anniversario della Dipartita, Matt Jamison si reca impulsivamente in Australia cercando di riportare Kevin a casa.