Un giorno di ottobre, improvvisamente, il 2% della popolazione mondiale (140 milioni di persone) scompare in un solo istante. Alcuni si convincono che la Terra sia stata colpita dal "Rapimento della Chiesa", altri rifiutano di vederlo come un evento mistico, e nessuno, in realtà, sa veramente cosa sia accaduto. La serie ha inizio tre anni dopo l'evento, e segue le vicende della comunità di Mapleton, dove sono scomparsi nel nulla oltre cento abitanti.
Sono trascorsi tre anni da quando Miracle è stata invasa dai CS e Kevin lavora di nuovo come poliziotto. In giro la gente pensa che con il settimo anniversario della Dipartita porterà una catastrofe apocalittica.