La famiglia Soprano, i cui avi italiani sono originari di Avellino, vanta importanti contatti con le cosche newyorkesi e mantiene relazioni affaristiche con la Camorra napoletana. Il boss è soggetto ad attacchi di panico che lo portano sul lettino di una psicoanalista, alla quale confida ben presto i suoi turbamenti legati alla famiglia, in particolare nel rapporto col terribile personaggio della madre Livia: i suoi guai però passano anche attraverso il complesso legame con la moglie Carmela (connivente ma estranea alle imprese criminali del marito), i figli adolescenti, lo zio (fratello del padre) che non lo considera come boss e lo contrasta in ogni modo. A questi problemi personali si aggiungono quelli "lavorativi", in cui Tony deve destreggiarsi fra l'FBI, traditori della sua stessa famiglia e boss in ascesa di famiglie rivali.
Alcuni membri della malavita liberi su cauzione cambiano volto all'alleanza Soprano/Lupertazzi. Nel frattempo, Janice porta avanti la tradizione della cena domenicale in famiglia; Carmela e A.J. familiarizzano con la fauna locale; Christopher si rifiuta di pagare il conto della "serata delle comari"; Tony cerca di far conoscere alla dottoressa Melfi un altro lato di sé.
Il trapasso di Carmine apre nella famiglia nuove ferite, mentre il cugino Tony cerca di lasciarsi il passato alle spalle. Intanto Tony Soprano scopre un traditore...
La morte di Carmine e l'arrivo di Feech danno il via alla guerra per il territorio nell'intero New Jersey. Intanto Carmela cerca di riprendere il controllo su Anthony.
Mentre Feech cerca di tornare agli antichi fasti rievocando il passato, Tony e Carmela hanno un penoso incontro con gli insegnanti di Junior, che e' ormai fuori controllo.
I suoi sentimenti per Adriana spingono Tony a tornare a parlare con la dottoressa Melfi. Intanto mentre Christopher e' fuori nascono dei pettegolezzi proprio su Adriana.
Tony B. fa un serio tentativo di rimettersi in riga, ma qualcosa glielo impedisce. Intanto Anthony Junior, dopo una litigata con Tony, torna a vivere con sua madre.
Carmela invita Tony a partecipare alla festa di compleanno del padre: il party finira' con una sorpresa. Intanto Tony Blundetto riceve un'offerta che non puo' rifiutare.
A Chris e al cugino Tony viene affidato un compito che fara' emergere le loro differenze caratteriali. Intanto il temperamento di Janice la mette in una situazione imbarazzante.
L'amante di Tony ha un brutto incidente e finisce in ospedale. Intanto il cugino Tony viene a sapere la verita' sulla morte del suo vecchio amico Angelo.
Tony si rende conto di una cosa importante: se vuol mantenere la pace nel suo clan, dovra' occuparsi per prima cosa delle complicate relazioni della sua stessa famiglia.